头颈部
头颈部特别是从鼻，鼻窦到颅底的肿瘤是所有肿瘤中发生率极低且转移率也相对较低。因靠近重要器官所以是质子治疗的良好的适应症。
质子治疗的适应症
在其他有希望的治疗方法中，以下是可以充分利用质子治疗特征的适应对象。
女性或是不想手术者
手术，可能面部会有损伤。
进行质子治疗后的急性期中，由于皮炎使皮肤颜色发生变化，但在治疗后3到6个月内几乎全部可恢复到原来的颜色。
如强烈不希望在脸上用手术刀，则可使用质子治疗（但是，根据肿瘤的类型和进展程度，有可能建议进行手术）。
眼周围的疾病
如果病灶在眼周围，可能需要手术切除眼睛，此外，放射治疗导致失明的风险很大。即使保留眼睛也会留下没有任何功能的后遗症。
质子疗法具有出色的瞄准射击的性能，它能避开视神经，只照射眼周围的肿瘤。
首选质子疗法的肿瘤是?
虽然成果还在发展中，但在某些疾病中，质子治疗可能会在将来成为标准治疗方法。
鼻，鼻窦恶性黑色素瘤
据报道该病的发病率为十万分之一。主要进行颅底手术。手术＋术后放疗是行业标准，近年来，治疗成果已达到顶点
一般治愈率仅为30%，如果太大而无法切除，则没有治愈的方法。
在本院，对14例（T4:9例)的初步研究显示3年生存率为58%
目前对于鼻/鼻窦恶性黑色素瘤的质子治疗单独疗法的第Ⅱ期临床试验正在进行中。
软骨肉瘤
虽然在该院的成果还不十分明确（因为病例少）但是在MGH的质子治疗中局部控制率超过90%，与手术相比，质子治疗更加安全且有较理想的成果。
嗅神经母细胞瘤
与头颈科，内科合作单独进行质子治疗或抗癌剂组合的治疗，在本院相对来说是被介绍较多的疾病。病情的进展程度决定治疗方法。
Kadish A期
基本上通过手术可以治疗。以女性为首比较注重审美（脸的变形）者进行质子治疗单独疗法。
Kadish B期
基本上使用质子治疗单独疗法。肿瘤大的情况下，会联合使用抗癌药。如手术则是颅底手术，所以以女性为首注重审美（脸部变形）者是首选的治疗方法。
Kadish C期
处于严重的晚期状态，通过手术也可能无法全部摘除。在本院推荐使用化学疗法→质子治疗＋抗癌药物的治疗方案。
已有被治愈者，是今后有希望被推广的治疗方法。
